Čekoslovakijai pasidalijus į dvi valstybes, 1993 m. sausio 1 d. susikūrė nepriklausoma Čekijos Respublika, netrukus pripažinta daugelio pasaulio valstybių. Nuo 1993 m. Čekija – ir Jungtinių Tautų narė. Paskutinis Čekoslovakijos prezidentas V. Havelas 1993 m. buvo išrinktas ir pirmuoju Čekijos prezidentu (perrinktas 1998 m. sausį), sudaryta Demokratinės piliečių partijos, krikščionių demokratų ir kitų centro dešiniųjų partijų vyriausybė (ministras pirmininkas V. Klausas). Siekta sukurti rinkos ekonomiką, vykdyta privatizacija. 1996 m. parlamento rinkimus vėl laimėjo centro dešiniosios partijos. 1996 m. Čekija oficialiai kreipėsi dėl priėmimo į Europos Sąjungą ir 2002 m. lapkritį buvo į ją pakviesta (narystė numatyta nuo 2004 m. gegužės).
Šalis nuolat palaikė glaudžius santykius su Slovakija, Vengrija ir Lenkija (šios valstybės sudaro Vyšegrado grupę). 1997 m. gruodį, V. Klausui atsistatydinus, sudaryta Josefo Tošovskýʼo vadovaujama vyriausybė. 1998 m. pirmalaikius parlamento rinkimus laimėjo socialdemokratai, ministru pirmininku tapo Čekijos socialdemokratų partijos vadovas M. Zemanas. 1999 m. kovo mėn. Čekija buvo priimta į NATO. Po 2002 m. rinkimų iki 2004 m. valdė socialdemokratų vadovaujama 4 partijų koalicija (ministras pirmininkas Vladimíras Špidla). 2003 02 Čekijos prezidentu išrinktas V. Klausas.
Atsiliepimai